【2026年6月改定】調剤基本料の届出方法｜区分判定から提出書類・期限まで完全ガイド

「うちの薬局、4月から調剤基本料の区分が変わるかもしれない…でも、何をどう届け出ればいいのかわからない」

2026年6月の調剤報酬改定は、調剤基本料の区分要件・点数・経過措置に細かい変更が入ります。届出が1日でも遅れると、本来取れたはずの点数が翌月以降に持ち越し、年間で数十万〜数百万円の機会損失につながりかねません。

この記事では、調剤基本料の区分判定から届出書類の準備、提出スケジュール、よくある差し戻し事例まで、開設者・管理薬剤師が今日から動ける形で整理しました。最後に「5月中にやる3つのこと」もまとめています。

結論：6月改定後の流れは「区分再判定 → 届出（変更/新規） → 7月以降の運用整備」

2026年6月改定における調剤基本料の対応は、次の3ステップで完了します。

1. 告示で定められた集計対象期間の実績（処方箋受付回数・集中率・グループ規模）を集計し、新区分を判定
2. 変更がある場合は5月末までに地方厚生（支）局へ届出を提出
3. 6月1日以降のレセコン点数マスタ・服薬指導書・領収証様式を更新

※点数や細目は、施行直前の厚労省告示・通知で必ずご確認ください。本記事は2026年5月時点の公開情報をもとに整理しています。

調剤基本料とは｜2026年改定の区分整理

調剤基本料は、薬局が処方箋を受け付けたときに必ず算定される、いわば「基本料金」です。薬局の規模・処方箋集中率・グループ構成によって5つの区分に分かれます。

調剤基本料1（地域型の標準区分）

地域に根ざした、いわゆる「面で受ける」薬局の基本区分。地域支援体制加算1〜4も同区分が前提です。

調剤基本料2（集中率＋受付回数で判定）

処方箋集中率が高く、月の受付回数が多いなど、特定の医療機関に依存する大規模店が該当します。

調剤基本料3イ・ロ・ハ（チェーン薬局）

同一グループの薬局数が一定規模を超える場合に該当。グループ全体の構造で点数が下がる仕組みです。

特別調剤基本料A・B

届出未済・敷地内薬局・妥結率不足など、要件を満たさない薬局向けの低い区分。算定漏れ・通知漏れで該当してしまうケースに要注意。

届出が「必要な薬局」と「不要な薬局」

すべての薬局が新たに届出をやり直す必要はありません。次の判定で見分けます。

届出書類と添付書類（チェックリスト）

提出先は各地方厚生（支）局。郵送または持参で受け付けます。基本のセットは次のとおりです。

• ☐ 基本診療料の施設基準等に係る届出書（様式87の3 等）
• ☐ 調剤基本料の施設基準に係る届出書添付書類（様式86）
• ☐ 処方箋受付回数・集中率の実績がわかる資料（告示で定められた集計対象期間分）
• ☐ 同一グループ薬局の一覧（基本料3該当時）
• ☐ 妥結率の状況がわかる資料（特別基本料回避の確認用）
• ☐ 開設許可証の写し（新規届出時）

様式は地方厚生局のサイトで毎年改定版が掲載されます。「2026年度版」のPDFを必ず使ってください。古い様式での提出は差し戻しの第1原因です。

届出スケジュール｜5月準備〜7月運用整備までのタイムライン

よくある間違い・差し戻し事例

• 古い様式で提出：年度版の差し替え忘れが第1位
• 集中率の算定期間を間違える：告示で定められた期間以外で集計してしまう例が多い
• 同一グループの定義漏れ：株式の50%超保有・運営委託・フランチャイズも含むケースがある
• 地域支援体制加算と別々に出す：同時提出が原則。後出しは加算が翌月以降になる
• 妥結率の資料未添付：特別調剤基本料回避のため必ず必要

Q&A

Q1. 5月末を過ぎたら7月施行扱いになりますか？
A. 原則として、提出が遅れた月の翌月から新区分が適用されます。1か月分の点数差が発生します。

Q2. 区分が「下がる」場合も届出は必要ですか？
A. 必要です。事実と異なる区分で算定し続けると返還対象になります。

Q3. グループ薬局の「グループ」はどこまで含みますか？
A. 資本関係50%超のほか、業務委託・統一ブランドの実態がある場合も含めて判定されます。

Q4. 集中率はどう計算しますか？
A.「同一医療機関からの処方箋枚数 ÷ 全処方箋枚数」で算出します。算定対象期間は告示で定められるため、地方厚生局通知でご確認ください。

Q5. 届出書はオンライン提出できますか？
A. 現時点では郵送・持参が中心。地方局によって電子受付の試行運用があります。

まとめ｜5月中にやる3つのこと

1. 告示で定められた集計対象期間の処方箋受付回数・集中率を確定させる
2. 地方厚生局サイトから2026年度版の様式をダウンロードし記入
3. 地域支援体制加算と同時に5月末までに提出、受理印を必ず確認

調剤基本料は「気づいたら下がっていた」では取り返しがつかない、薬局経営の土台です。今日のうちに前年実績の集計指示を出しておきましょう。